Abordagem NGS para a Descoberta da Variante em Camarão Gigante de Água Doce [Portuguese]

Entre os crust ceos cultivados, o camar o gigante de gua doce Macrobrachium rosenbergii era at h pouco tempo uma das principais esp cies com elevado valor comercial. Ultimamente, tem perdido popularidade devido a doen as e crescimento diferencial dos machos por causa da hierarquia social. A esp cie pode readquirir o seu antigo estatuto preferido se for geneticamente melhorada para o crescimento e resist ncia s doen as. A reprodu o selectiva grandemente facilitada pela selec o assistida por marcadores (MAS). Os polimorfismos de nucle tidos nicos (SNPs) oferecem a melhor resolu o poss vel para um mapa marcador (uma nica mudan a de nucle tidos), s o co-dominantes, bi-al licos e geralmente abundantes em popula es com uma baixa taxa de muta o. A sequencia o do ADN atrav s de plataformas NGS considerada como a abordagem mais rent vel. Neste estudo, a explora o mineira SNP foi realizada nas sequ ncias transcritas de M. rosenbergii dispon veis no GenBank, NCBI. Foram recolhidos esp cimes selvagens de diferentes massas de gua. Os prim rios foram concebidos para amplificar a codifica o (CDS) e sequenciaram os amplicons nas plataformas GS-FLX 454 e Ion torrent. Foram detectados 173 SNPs entre popula es. Esta abordagem para os SNPs de minera o em sequ ncias relatadas foi utilizada por n s pela primeira vez.